锦鲤稚鱼的选择通常分为两类：毛仔购入型、稚鱼购入型。
(1)毛仔购入型 喜欢购入毛仔的爱好者，常购入2～3厘米的仔鱼培育。此种方式需要一定的技术，主要应注意：
第一，应选择优良种鲤产下的仔鱼。
第二，要有相当的饲育技术。主要是注意水质变化、饵料更换等。
第三，必须严格地挑选。因大批量购人毛仔，而其中能得到的好鱼其实不多。本来素质良好的锦鲤是潜在的，但由于没有选别，将之与精力旺盛、生命力强的原种鲤养在一起，它的潜在优势必会消失殆尽。
具体选别法则是：在孵化后1～3个月内进行3～4次。第一次
选别时，去掉畸形、变形和全黑、白无地、赤无地等；第二次选别就
是尽早淘汰劣质鲤，保护良质锦鲤。
(2)稚鱼购入型 指选购5～10厘米稚鱼饲养至20~30厘米或更大者。在业者进行第二、第三次选别时，选择几十尾有培养前途的稚鱼。这种方法需具独到的鉴赏眼光。
选购红白、大正三色、昭和三色要选择红斑纹的配置良好者。因为红斑纹很少有大的变化。另外，斑纹边缘清晰、色彩浓厚者才有前途。
这个时期的稚鱼如果色彩太淡薄，虽然花纹漂亮，但不容易上彩，因此也不宜选取。选择黑斑时，初学者喜欢选择黑斑大而多、已是完成好的黑斑，殊不知这种黑斑会随着鱼体生长而集中变大，而后易于褪化而分散。因此，应以选择白底上隐约可见的黑斑纹者为宜。
最重要的是选择健康而体格粗大者。如果花纹构图非常漂亮但体弱有病、变形、有外伤等不健康者，也要坚决舍弃。另外，要选择素质良好的稚鱼。其一要看种鲤是否优良，其二要凭自己的经验来鉴赏与挑选。白质、红质、黑质必须优良。随着鱼体成长，会有一些褪色和体形有异者，应及早淘汰。
一般有经验人士常会观察，如头部骨骼较大呈圆形，尾部粗料者及背鳍、胸鳍呈白色者为佳，不可有红斑、黑斑。大正三色黑斑不宜太多，胸鳍上最多只可有3条左右黑条纹。
