黄鳝的肠道无盘曲，呈直管状，总长度约占体长的五分之四，这一结构与肉食性鱼类的特征想似。其消化特点是：对植物蛋白和纤维素几乎完全不能消化，对动物蛋白、淀粉和脂肪能有效消化，因此任何使用植物性饲料饲养黄鳝的企图都是对黄鳝的消化机能缺乏了解的表现。但另一方面适度植物性饲料的添加可促进肠道的蠕动和摄食强度。黄鳝的新成代谢缓慢，反映在消化系统主要表现为消化液分泌量少，吸收速率低。这一特性对养殖是极为不利的，因为严重抑制了增重速度。然而这一特性并非不可改变，在定时投喂和人为添加消化促进剂的激活下，消化系统可很快变得极为活跃，就可达到促进进食，增重状况得以明显改善。
