近年来，山东微山县结合各乡镇养殖特点，通盘考虑产业基础、畜牧资源、粪污处理和生态保护，稳规模、提效率、保生态，合理调整安排畜禽养殖用地，科学划定畜禽养殖禁养区、限养区、适养区，合理确定养殖品种、规模和总量，优化生态畜牧业布局，加强分类指导，有效促进了规范化生态畜牧养殖业发展。
一是科学制定畜牧业养殖规划，发展生态健康畜牧业。制订了《微山县畜禽养殖区域布局规划》，规划打造了肉蛋鸭养殖区、麻鸭生态养殖区、生猪养殖区、蛋鸡养殖区、特种动物养殖区等一批特色畜牧业专业区域。二是加强对养殖场区设计改造。对新上养殖场一律配套粪污无害化处理设施，达到标准化养殖场建设要求；引导资金、技术实力比较强的规模养殖场户进行畜禽养殖垃圾处置的配套化、规范化改造，发展生态畜产品和商品有机肥生产，发展循环产业，促进提质增效。三是依托项目建设，加快畜牧业生态健康养殖进程。积极做好省市标准化建设项目，畜牧业标准化、品牌化进程不断加快。2014年以来实施了8处畜禽养殖废弃物无害化处理示范工程项目，对19处养殖场通过推广雨污分离、病死畜禽及粪污无害化处理综合利用技术减少污染排放，改造升级养殖场8处，新建高标准养殖场7处，新增规模养殖户13户，全部达到标准化养殖场生态健康养殖要求，全县规模养殖比重达到80%以上。四是深入推进南水北调沿线畜禽养殖污染治理工作。按照实施方案和治理方案要求，全面取缔河道畜禽养殖，以及河道大堤外两侧1公里范围内畜禽养殖场治理改造，完成了南水北调核心区及河道大堤内151家畜禽养殖场（户）关闭清理及畜禽处置工作、南水北调核心区及河道大堤外两侧1公里范围内232处畜禽养殖场（户）治理改造。同时大力推广现代化养殖新模式，积极开展了“退村进区”工程，实行相对封闭、统一管理，逐步实现畜禽养殖垃圾处置的配套化、规范化。
