菠菜定型品种的采种方法有大株采种法和小株采种法两种。前一种方法通常在秋季播种，露地越冬，第二年抽苔开花结实。这种方法占地时间较长，用工多，成本大，但是能根据植株的生长情况去杂去劣，种子质量好，一般原种生产均用此法繁殖。后一种方法采用秋季迟播小苗越冬或冬末春初播种，不形成大苗即抽苔开花结实，此法占地时间短，用工少，成本较低，但因无法对植株在生长阶段进行选择，所以种子质量相对较差，种子产量也较低，故仅限于繁殖生产用种。值得注意的是，无论采用何种方法采种，因菠菜为异花授粉蔬菜，所以必须进行严格隔离，原种繁殖的隔离距离应在2000米以上，生产用种繁殖时也必须保持1000米以上的隔离距离。
1.大株采种法也称秋播越冬采种或老根采种法。在华南地区，以10月下旬至11月播种为宜。种子在播前进行浸种催芽，先用清水浸泡12～14小时，搓洗沥干，用湿布包好，置于15℃。20℃温度下催芽，每天须用清水洗1次，3～4天后播种。
待春后气温升高时，对留种植株应适当控制浇水施肥，以防徒长，并结合去杂去劣定苗，使株行距保持在20厘米*25厘米左右。进入抽苔初期再去劣一次，拔除早期抽苔的植株。当花蕾伸长后，拔除绝对雄株及部分生长不良的营养雄株，花期过后再将其余营养雄株全部拔除。
菠菜种子充分成熟后容易脱落，且株间成熟期不一致，因此，当较晚成熟的种株开始变黄时，就应该全部采收。将收获后的种株捆成小捆，后熟晾晒几天，待种株充分干燥后，在帆布或篷布上用碾子压碾或用脱粒机脱粒。然后风选2～3次，净选后的种子再晒3～4天后进行装袋贮藏。
2.小株采种法华南地区可在12月下旬至2月上旬播种，播种前进行浸种催芽，出苗后，当苗高长至3～5厘米时追一次肥，幼苗长至10～15厘米时，进行定苗。密度可较大株采种时大一些，以18厘米*20厘米的株行距为宜。其他田间管理及采种技术与大株采种法基本相同。
