轮状病毒：在新生仔猪的最初几周内，几乎所有的仔猪都可被轮状病毒感染，但大多数病例都呈亚临床症状。当持续不断的产仔房内的病毒超过了仔猪的被动免疫保护力时，就会出现感染的临床症状。Benfield报告，对轮状病毒具有免疫力的母猪在产仔前3天和产仔后2周内可经粪便排出病毒。新生仔猪感染轮状病毒后会出现柠檬黄或奶酪样腹泻。年龄较大的仔猪腹泻比较温和，持续时间也比较短。如果仔猪缺乏被动免疫力，病毒增殖足以使6～7日龄的仔猪感染，其临床症状是比较严重的。发病率通常为80～100%，死亡率为5～20%。如果病毒感染的同时继发细菌感染造成的死亡率会大为增加。
球虫病：在6～10日龄的仔猪，被诊断为球菌病的日益增多。较大规模的集约化养猪生产可能增加了球虫病的流行。在7～8月份猪球虫病的发生年可能增加。
感染猪开始抽拉黄褐色至灰色的糊状粪便，一两天后继而变成水样腹泻。腹泻持续4～8天直到严重脱水。在混凝土地板或板条的产仔房内，球虫病发病率可以达100%。在木板地板的产仔房内，发病率也可以比较高。死亡率为0～20%，这要取决于是否同时有继发感染和环境应激因素。
虽然在猪已鉴定出几个球虫种类，但已经知道的对年轻仔猪有致病力的种仅有猪等孢球虫(Isosporn suis)。形成孢子的卵囊被仔猪食入后，释放出孢子虫，大部分渗入空肠和回肠的上皮细胞内，进行无性繁殖。大约(在食入)5天后，进入
有性繁殖阶段，卵囊经粪便排出。Harleman和Meyer报道了猪等孢球虫肠道外生活史，卵囊食入后在排出的10～14天可引起第二次高峰。
在流行的猪场，可以预先知道哪一天仔猪要发生腹泻。猪只开始通常不活泼，大部分时间躺在靠近热源的地方，第二天就可发生腹泻。
产气荚膜梭菌(Clostridiumperfringens)：虽然C型产气荚膜梭菌通常可使3～5日龄仔猪发生急性腹泻，但是在5～14日龄仔猪也可引起C型产气荚膜梭菌慢性感染。这些仔猪出现临床疾病2～3天后出现腹泻和脱水。这种疾病常呈散发，同一窝仔猪仅3或4头感染，而其余的仔猪可能是健康的。
兰氏类园线虫(Strongyloidesransomi)：虽然肠道线虫主要在美国东南部是一个问题，但是中西部州的兽医人员对这些寄生虫也是重视的。幼虫可经感染母猪的初乳传给哺乳的仔猪。食入的幼虫可引起空肠上皮细胞脱落使6日龄仔猪发生腹泻。可看到仔猪厌食、腹泻、脱水和精神沉郁。
