在彻底清理被污染的病畜舍之前，须用0.5%的过氧乙酸或喷雾灵等消毒剂对其进行喷雾消毒；彻底将病畜舍内的粪便、垫草、垫料、剩草、剩料等各种污物清理干净，对清理出来的污物进行无害化处理。将可移动的设备和用具搬出畜舍，集中堆放到指定的地点进行清洗和消毒；病畜舍经清扫后，用火焰喷射器对畜舍的墙裙、地面、用具等非易燃物品进行火焰消毒；病畜舍经火焰消毒后，对其墙壁、地面、用具，特别是屋顶木梁、柁架等，用高压水枪进行冲刷，清洗干净，冲洗后的污水要收集到一起进行消毒，并做无害化处理；待病畜舍地面水干后，用消毒液对地面和墙壁等进行均匀、足量的喷雾或喷洒消毒。为使消毒更加彻底，首次消毒冲洗后间隔一定时间，进行第二次甚至第三次消毒；熏蒸消毒，病畜舍经喷洒消毒后，关闭门窗和风机，用福尔马林密闭熏蒸消毒24小时以上。
