本病的特征性的病变发生于肾脏和膀胱。表现为膀胱和肾孟的炎症。尿道、膀胱和输尿管炎症反应可表现为卡他性、纤维素性及出血性或坏死性。
肾脏病变：肾脏眼观肿大，呈暗红色，被膜下见细小的黄白色化脓灶；严重的肾脏肿大可达正常的2倍以上。被膜易剥离，病程较久者则部分粘连于肾表面。病肾由于化脓而形成灰黄色小坏死灶，致肾表面呈斑点状。切面可见肾孟由于渗出物和组织碎屑的积聚而扩大，肾乳头坏死。肾盂扩张，皮质变薄，或因肾盂的扩张而发生压迫性萎缩。肾孟内积有灰色无臭的脓性渗出物，并混有纤维素凝块、小凝血块、坏死组织和钙盐颗粒。肾盂黏膜充血或出血，被覆纤维素或纤维素性脓性渗出物。在髓、皮质中可见到由溃烂缺损的乳头顶端向髓质和皮质伸展的呈灰黄色放射状条纹或楔状病灶，此即为病原体沿肾小管上侵而形成的化脓灶。
膀胱病变：膀胱壁增厚，内含恶臭尿液，其中混有纤维素、脱落坏死组织或脓汁，黏膜肿胀、出血、坏死或形成溃疡，表面常覆有脓性假膜。一侧或两侧输尿管肿大变粗，内含脓汁，黏膜肿胀或坏死。
镜下：肾组织乳头部顶端，有的完全坏死，坏死区向皮质伸展，周围环绕充血带。肾小球和肾小囊周围有多量嗜中性白细胞浸润，混有多量细菌。病变严重的部位整个肾单位均坏死，在肾实质内形成大小不一的化脓灶。肾小管上皮细胞变性、坏死，伴发化脓性管型形成，内含大量崩解的嗜中性白细胞。肾小管的间质明显充血、出血、水肿及嗜中性白细胞浸润和聚集。在身体其他部位，无相关病变出现。
