砧木苗有80%发芽抽梢1cm长时才可开始施肥，每半月浇一次水肥，用10%人粪尿或0.3%～0.4%复合肥。5月下旬和8月上旬各隔行开50cm深的沟施一次沤熟饼肥，每667平方米施150～200kg，加速砧木增粗生长。经常剪除离地面20cm内的分枝和剌，保持嫁接部位光滑，注意田间红蜘蛛、潜叶蛾和立枯病的防治。
在畦面上可用小耙子除草，行间和株间的草易除掉，又不会伤及根系。四周田坎可喷草甘膦和农达等除草剂除草，但畦面、畦沟不能喷。有些资料介绍，在枳休眠期可使用除草剂，但实际中会造成重大损失，喷了除草剂的枳苗表现为：枳芽呈聚集状，迟迟不发，如嫁接了芽片，芽片死亡率达30%以上，即便不死，2～3个月芽片也不萌发，即使芽偶尔萌发，柑桔叶片也呈柳叶状，完全变态。砧木根系霉烂，砧木芽、接芽丛生，损失惨重。干旱季节要保持土壤湿润，6～9月应在傍晚灌水，第二天上午9时前排水，并且水位不超过畦面。
